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什么是BLAST?

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摘要:是美国国立医学图书馆的注册商标。是生物信息学常用的工具软件,可将输入的核酸或蛋白质序列与数据库中的已知序列进行比对,获得序列相似度等信息,从而判断序列的来源或进化关系。

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BLAST是由NCBT开发的一款多平台服务软件,它的全称叫做Basic Local Alignment Search Tool,即“基于局部比对算法的搜索工具”,是由美国国家生物技术信息中心(National Center for Biotechnology Information,NCBI)开发和管理的一套生物大分子一级结构序列比对程序。"BLAST"是美国国立医学图书馆(U.S. National Library of Medicine)的注册商标。

BLAST是生物信息学常用的工具软件,可将输入的核酸或蛋白质序列与数据库中的已知序列进行比对,获得序列相似度等信息,从而判断序列的来源或进化关系。

BLAST即基于局部序列比对算法的搜索工具。BLAST程序有在线版亦有本地版。在线版可将输入序列与庞大的已知来源序列信息库进行比对,一般用于确定未知序列的来源,以及寻找不同物种中的同源基因;本地版是将输入序列与本地自行构建的序列信息库进行比对,比对的针对性更强,常用于在未发表基因组数据库中寻找同源基因信息,不依赖于网络,安全性和可靠性更高。

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