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[原]R语言工程化实践:RStudio Server环境快速配置教程

UsherChen / 3369人阅读

摘要:在实际的工程中,我们的服务器大多是基于的,比如常见的等。这一次,我们将继续利用神器,快速初始化环境的配置,并结合实现代码的版本控制。对于的问题,我们可以选择建立一个认证的,也可以在中设置为忽略。

介绍

RStudio Server 是 RStudio 公司打造的一款基于 Web 的开源编辑器,如果你熟悉 RStudio的桌面版本,那么使用RStudio Server对你来说基本上没什么难度。

在实际的工程中,我们的服务器大多是基于Linux的,比如常见的 ubuntu、centos 等。这些操作系统有时并不提供图形化界面,这时候RStudio的服务器版本就派上用场了。启动RStudio Server后,进入在浏览器中进入某一个页面后就可以像桌面版一样使用RStudio编辑器。当R的代码在服务器上出现bug了,线上的hotfix是在所难免的,这时候必然会用到 RStudio Server 应个急。

这一次,我们将继续利用Docker神器,快速初始化RStudio Server环境的配置,并结合Git实现代码的版本控制。

准备

一个 Ubuntu 服务器

第一步:安装 RStudio Server

首先,我们通过docker 安装一个标准的RStudio Server

docker pull index.tenxcloud.com/7harryprince/sparkr-rstudio
docker run -d -p 8787:8787 index.tenxcloud.com/7harryprince/sparkr-rstudio

这样在你的电脑的8787端口就可以访问到rstudio的登陆界面了。

第二步:初始化 RStudio 账号

接着,我们需要初始化一个rstudio的账号

docker exec -it container-id /bin/bash
adduser harryzhu # 设置新用户名
passwd harryzhu # 设置该用户的密码
mkdir /home/harryzhu # 初始化工作空间
chmod -R harryzhu /home/harryzhu # 给工作空间赋权
第三步:安装 git

然后,我们进入rstudio的服务器,我们打算引入git版本控制

sudo apt-get install git-core
第四步:解决 ssh 的认证问题

使用 git 的过程可能遇到SSL certificate problem。对于ssh的问题,我们可以选择建立一个ssh认证的key,也可以在git中设置为忽略。

生成一个key:

$ssh-keygen -t rsa        
Generating public/private rsa key pair.
Enter file in which to save the key (/root/.ssh/id_rsa): 
Created directory "/root/.ssh".

连续按下回车,跳过密码设置
显示秘钥信息:

sudo cat /root/.ssh/id_rsa.pub

如果没有ssh认证的需求,也可以选择忽略:

git config --global http.sslVerify false
第五步:在 RStudio Server 中配置Git

在最上方的菜单栏中可以选择Project Options

接着填写配置。

第六步:克隆 Git 项目到本地

Git 功能已经集成在 RStudio-Server 中了,在新建项目时可以选择新建一个Version Control 的 Git 项目。

大功告成!

参考资料

docker-rstudio 手册

张丹老师的 RStudio-Server 配置实战

Rstudio 官方 git 解决方案

刘坤老师的 Git 中文教程

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