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交互式的开发环境 - ipython

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摘要:与操作系统交互在系统中执行将系统目录更改为调试器在执行完代码,如果出现错误,立即执行命令后将会进入调试器。性能分析用来测试各个部分或者函数的执行时间,它会自动多次执行以产生一个非常精确的平均执行时间。比的性能要快两倍以上。

本文介绍如何使用ipython进行快速的实验和调试,闲话免谈,直接通过demo进入主题。

与操作系统交互 !cmd

在系统shell中执行cmd

In [35]: !ls
Gemfile        Gemfile.lock    README.md    Rakefile    bin        config        db        log        src
%cd directory

将系统目录更改为directory

In [36]: %cd -
/private/tmp
调试器 %debug

在执行完代码,如果出现错误,立即执行%debug命令后将会进入调试器。在接触%debug之前,笔者都是使用的是pdb.set_trace来调试程序,这样的硬编码非常之不方便。

In [45]: !touch a.py
In [46]: !vim a.py
In [47]: !cat a.py
def divide():
    assert(1 == 0)

divide()
In [56]: %run a.py
---------------------------------------------------------------------------
AssertionError                      Traceback (most recent call last)
/private/tmp/a.py in ()
      2     assert(1 == 0)
      3
----> 4 divide()

/private/tmp/a.py in divide()
      1 def divide():
----> 2     assert(1 == 0)
      3
      4 divide()

AssertionError:

In [57]: %debug
> /private/tmp/a.py(2)divide()
      1 def divide():
----> 2     assert(1 == 0)
      3
      4 divide()
%run -d xxx.py

同样立即进入调试器。

性能分析 %timeit

用来测试各个部分或者函数的执行时间,它会自动多次执行以产生一个非常精确的平均执行时间。

In [12]: strings = ["foo", "foobar", "baz","qux", "123 ffd"] * 100000
In [13]: %timeit method1 = [x for x in strings if x.startswith("foo")]
10 loops, best of 3: 93.4 ms per loop
In [14]: %timeit method2 = [x for x in strings if x[:3] == "foo"]
10 loops, best of 3: 36.4 ms per loop

method2 比 method1 的性能要快两倍以上。

%run -p

python的主要性能分析工具是cProfile模块,它会记录各个函数的耗费时间,在命令行中,可以通过如下命令来进行性能分析:

python -m cProfile xxx.py

而在ipython中,会使用下面的命令来运行一个文件

%run -p -s cumulative xxx.py
%prun

如果想要运行一个函数或语句,请使用如下命令:

%prun -l 7 -s cumulative run()

待测函数:

In [17]: from numpy.random import randn
In [18]: x = randn(3000, 3000)
In [19]: y = randn(3000, 3000)
In [20]: def add_and_sum(x,y):
    ...:     added = x + y
    ...:     summed = added.sum(axis=1)
    ...:     return summed
    ...:

使用prun的结果如下:

In [21]: %prun add_and_sum(x, y)
         6 function calls in 0.340 seconds

   Ordered by: internal time

   ncalls  tottime  percall  cumtime  percall filename:lineno(function)
        1    0.310    0.310    0.335    0.335 :1(add_and_sum)
        1    0.025    0.025    0.025    0.025 {method "reduce" of "numpy.ufunc" objects}
        1    0.005    0.005    0.340    0.340 :1()
        1    0.000    0.000    0.025    0.025 {method "sum" of "numpy.ndarray" objects}
        1    0.000    0.000    0.025    0.025 _methods.py:31(_sum)
        1    0.000    0.000    0.000    0.000 {method "disable" of "_lsprof.Profiler" objects}

上面的结果不是很好理解,笔者更喜欢用line_profiler库来分析。

%lprun

使用一个库line_profiler,这个库的输出结果简单易理解。
这个库不是内建的,需要手动安装,安装命令:

pip install line_profiler

然后在ipython中手动load lprun:

In [2]: %load_ext line_profiler
In [3]: %lprun
Timer unit: 1e-06 s

待测函数:

In [17]: from numpy.random import randn
In [18]: x = randn(3000, 3000)
In [19]: y = randn(3000, 3000)
In [20]: def add_and_sum(x,y):
    ...:     added = x + y
    ...:     summed = added.sum(axis=1)
    ...:     return summed
    ...:
In [21]: def call_function():
    ...:     x = randn(1000, 1000)
    ...:     y = randn(1000, 1000)
    ...:     return add_and_sum(x, y)

使用lprun后的结果如下:

In [23]: %lprun -f add_and_sum  -f call_function call_function()
Timer unit: 1e-06 s

Total time: 0.004438 s
File: 
Function: add_and_sum at line 1

Line #      Hits         Time  Per Hit   % Time  Line Contents
==============================================================
     1                                           def add_and_sum(x,y):
     2         1         3929   3929.0     88.5      added = x + y
     3         1          508    508.0     11.4      summed = added.sum(axis=1)
     4         1            1      1.0      0.0      return summed

Total time: 0.062512 s
File: 
Function: call_function at line 1

Line #      Hits         Time  Per Hit   % Time  Line Contents
==============================================================
     1                                           def call_function():
     2         1        29193  29193.0     46.7      x = randn(1000, 1000)
     3         1        28449  28449.0     45.5      y = randn(1000, 1000)
     4         1         4870   4870.0      7.8      return add_and_sum(x, y)

通常,会使用%prun(cProfile)做“宏观”性能分析,而用%lprun(line_profiler)做“微观”性能分析。使用line_profiler必须要指定待测的函数,是因为这个库要跟踪每一行代码的执行时间。

基本名令 内省

在一个变量的前面或后面加上问号?,可以显示该变量的基本信息

In [23]: a=1

In [24]: a?
Type:        int
String form: 1
Docstring:
int(x=0) -> int or long
int(x, base=10) -> int or long
>>> int("0b100", base=0)
4

如果这个变量是函数的话,一个问号?来显示docstring,两个问号来显示该函数的源码

%timeit

检测python语句的执行时间

In [16]: %timeit  sum(i*i for i in xrange(1000))
10000 loops, best of 3: 68.6 µs per loop
%logstart

执行这个命令,开始记录控制台会话,这样可以将整个过程保存起来

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